Keiner kennt die Tiefen der sieben Meere besser als Steve Zissou, der mit seinem Team das Leben unter Wasser im U-Boot erforscht. Mit einer aufsehenerregenden letzten Expedition will er sich einen Platz in der Geschichte sichern. Doch bei seiner Jagd nach dem seltenen Jaguar-Hai sieht sich Steve Zissou mit Meuterei, Angriffen und zahllosen anderen Überraschungen konfrontiert...